Autores: Aaron Gálvez Salido (programador) y Rafael Navajas Pérez

Simulador de cruzamientos genéticos sin interacción génica, con interacciones génicas (tanto epistáticas como no epistáticas) y cruzamientos de hasta cuatro genes con ligamiento.

Guía de ayuda: en la barra superior del navegador pinche en el tipo de simulación que quiera realizar.

SIMULADOR SIN INTERACCIONES

En la casilla "Genotipo del padre", introduzca un genotipo de hasta tres genes con dos alelos cada uno. Los alelos de un mismo gen deben estar representados por la misma letra, que puede ser mayúscula y/o minúscula indicando dominancia y recesividad, respectivamente. Haga lo mismo en la casilla "Genotipo de la madre". El orden de los genes y, por tanto, su nomenclatura debe coincidir en ambos parentales. Indique la descripción de los fenotipos dominante y recesivo en las casillas correspondientes a cada rasgo. Complete la información para tantos rasgos como genes haya introducido en las casillas anteriores. Una vez hecho esto, pulse "Cruzar".

Aparecerá en la parte izquierda de la pantalla un cuadro de Punnett con los gametos de la madre en la primera columna y los gametos del padre en la primera fila, así como todas las combinaciones posibles entre los mismos en el resto de casillas. En la parte derecha, aparecerá una gráfica con las proporciones fenotípicas de la descendencia. En concreto, en el eje Y (ordenadas) se indica la proporción de fenotipos resultantes del cruzamiento y en el eje X (abscisas) los distintos fenotipos diferenciados según un código de colores. En la parte inferior de la gráfica se indican los porcentajes de cada fenotipo, así como un resumen de las proporciones relativas en las que aparecen.

Para ver un ejemplo, deje los datos introducidos por defecto y pulse "Cruzar". Para realizar un nuevo cruzamiento, basta con modificar los datos introducidos en las distintas casillas y pulsar nuevamente "Cruzar". Para cambiar de simulador elija desde la barra superior el simulador que desee. Para salir del programa, cierre el navegador normalmente.

SIMULADOR CON INTERACCIONES

En la casilla "Genotipo del padre", introduzca un genotipo de hasta dos genes con dos alelos cada uno. Los alelos de un mismo gen deben estar representados por la misma letra, que puede ser mayúscula y/o minúscula indicando dominancia y recesividad, respectivamente, salvo en el caso de los genes moduladores (ver más abajo). Haga lo mismo en la casilla "Genotipo de la madre". El orden de los genes y, por tanto, su nomenclatura debe coincidir en ambos parentales. Seleccione el tipo de interacción génica que quiera simular, pulsando el botón correspondiente:

- Interacción génica: simula una interacción génica sin alteración de las proporciones 9:3:3:1 en los cruzamientos entre diheterocigotos.

- Cooperación de genes: simula una interacción génica con modificación de las proporciones a 9:6:1 en los cruzamientos entre diheterocigotos.

- Genes moduladores: simula una interacción génica por genes moduladores, siendo el primer gen introducido el gen modulado y el segundo el modulador. Los alelos del gen modulado presentan una relación de dominancia completa, mientras que los del gen modulador presentan una relación de dominancia incompleta o intermedia. El cruzamiento entre diheterocigotos da lugar a unas proporciones fenotípicas 3:6:3:1:2:1 (6 fenotipos).

- Epistasis dominante: simula una interacción génica epistática simple dominante, siendo el primer gen introducido el gen epistático y el segundo el hipostático. El cruzamiento entre diheterocigotos da lugar a unas proporciones fenotípicas 12:3:1 (tres fenotipos).

- Epistasis recesiva: simula una interacción génica epistática simple recesiva, siendo el primer gen introducido el gen epistático y el segundo el hipostático. El cruzamiento entre diheterocigotos da lugar a unas proporciones fenotípicas 9:3:4 (tres fenotipos).

- Epistasis doble dominante: simula una interacción génica epistática doble dominante. El cruzamiento entre diheterocigotos da lugar a unas proporciones fenotípicas 15:1 (dos fenotipos).

- Epistasis doble recesiva: simula una interacción génica epistática doble recesiva. El cruzamiento entre diheterocigotos da lugar a unas proporciones fenotípicas 9:7 (dos fenotipos).

- Epistasis doble dominante-recesiva: simula una interacción génica epistática doble dominante-recesiva. El cruzamiento entre diheterocigotos da lugar a unas proporciones fenotípicas 13:3 (dos fenotipos).

En todos los casos, a continuación, aparecerá en la parte izquierda de la pantalla un cuadro de Punnett con los gametos de la madre en la primera columna y los gametos del padre en la primera fila, así como todas las combinaciones posibles entre los mismos en el resto de casillas. En la parte derecha, aparecerá una gráfica con las proporciones fenotípicas de la descendencia que aparecen según el tipo de interacción. En concreto, en el eje Y (ordenadas) se indica la proporción de fenotipos resultantes del cruzamiento y en el eje X (abscisas) los distintos fenotipos diferenciados según un código de colores. En la parte inferior de la gráfica se indican los porcentajes de cada fenotipo, así como un resumen de las proporciones relativas en las que aparecen.

Para ver un ejemplo, deje los datos introducidos por defecto y pulse la interacción que desee. Para realizar un nuevo cruzamiento, basta con modificar los datos introducidos en las distintas casillas y pulsar nuevamente el tipo de interacción deseado. Para cambiar de simulador elija desde la barra superior el simulador que desee. Para salir del programa, cierre el navegador normalmente.

SIMULADOR LIGAMIENTO

- Cálculo de distancias a partir de los datos de un cruzamiento de prueba de un di- o triheterocigoto: seleccione en el menú desplegable “Número de loci” si quiere trabajar con mapas de dos o tres puntos. En la casilla “Nombre de los marcadores”, indique el orden de los mismos, siendo el primero (M1) el más próximo al telómero. En los mapas de tres puntos el 2º marcador (M2) ocupa la posición central. Introduzca tantas letras como puntos haya seleccionado con anterioridad. Pulse “Ingresar”.

En los mapas de dos puntos: en la casilla “Número de recombinantes” introduzca el número de individuos producto de gametos recombinantes y en la casilla “Número total de individuos” introduzca el número total de individuos de la progenie. A continuación aparecerá la distancia estimada entre los dos marcadores.

En los mapas de tres puntos: en la casilla “Número de recombinantes simples entre M1 y M2” introduzca el número de individuos producto de gametos recombinantes en la región entre el 1º (M1) y 2º (M2) marcador, en la casilla “Número de recombinantes simples entre M2 y M3” introduzca el número de individuos producto de gametos recombinantes en la región entre el 2º (M2) y 3º (M3) marcador, en la casilla “Número de dobles recombinantes” el número de individuos producto de gametos doble recombinantes y en la casilla “Número total de individuos” introduzca el número total de individuos de la progenie. A continuación aparecerá la distancia estimada entre cada uno de los marcadores y el valor de interferencia.

- Cálculo de tipo de gametos y sus frecuencias a partir de datos de distancia: seleccione el número de genes con el que quiere trabajar en el menú desplegable "Número de genes", hasta un máximo de cuatro genes. En la casilla "Orden de los genes", indique el orden de los mismos, siendo el primero el más próximo al telómero. Introduzca tantas letras como genes haya seleccionado con anterioridad. Pulse "Ingresar". En la casilla "Distancia entre los genes", indique la distancia entre cada par de genes en CentiMorgans y pulse "Ingresar". Si desea introducir decimales, use "." en lugar de ",". En la casilla "Define los haplotipos", indique el orden y el tipo de alelo (dominante y/o recesivo) presente en un cromosoma (Haplotipo 1) y su homólogo (Haplotipo 2) y pulse "Generar cromosomas". Utilice para cada gen la misma nomenclatura, que ha de coincidir con la utilizada en las casilla "Orden de los genes". A continuación aparecerá la representación gráfica del par cromosómico con la posición física de los alelos introducidos. A la derecha, aparecerá un resumen de los gametos generados (tanto parentales como recombinantes) y la proporción en la que se forman.

Para realizar un nuevo cruzamiento, basta con modificar los datos introducidos en las distintas casillas y pulsar nuevamente "Cruzar". Para cambiar de simulador elija desde la barra superior el simulador que desee. Para salir del programa, cierre el navegador normalmente.